MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylobacterium nodulans ORS 2060 plasmid pMNOD05

Total Repeats: 338

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011888	CA	3	6	244	249	50 %	0 %	0 %	50 %	220915080
2	NC_011888	ATC	2	6	745	750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915081
3	NC_011888	GCG	2	6	808	813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915081
4	NC_011888	GC	3	6	819	824	0 %	0 %	50 %	50 %	220915081
5	NC_011888	CCT	2	6	885	890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220915081
6	NC_011888	GC	3	6	969	974	0 %	0 %	50 %	50 %	220915081
7	NC_011888	TCG	2	6	983	988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915081
8	NC_011888	CAT	2	6	1011	1016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915081
9	NC_011888	TCG	2	6	1040	1045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915081
10	NC_011888	TGGA	2	8	1095	1102	25 %	25 %	50 %	0 %	220915081
11	NC_011888	GC	3	6	1111	1116	0 %	0 %	50 %	50 %	220915081
12	NC_011888	AAG	2	6	1121	1126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220915081
13	NC_011888	AG	3	6	1354	1359	50 %	0 %	50 %	0 %	220915081
14	NC_011888	CGCC	2	8	1468	1475	0 %	0 %	25 %	75 %	220915082
15	NC_011888	ACC	2	6	1573	1578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220915082
16	NC_011888	GC	3	6	1602	1607	0 %	0 %	50 %	50 %	220915082
17	NC_011888	TCC	2	6	1608	1613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220915082
18	NC_011888	GTAA	2	8	1671	1678	50 %	25 %	25 %	0 %	220915082
19	NC_011888	GCG	2	6	1713	1718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915082
20	NC_011888	GGCC	2	8	1766	1773	0 %	0 %	50 %	50 %	220915082
21	NC_011888	CG	3	6	1828	1833	0 %	0 %	50 %	50 %	220915082
22	NC_011888	CCGC	2	8	1905	1912	0 %	0 %	25 %	75 %	220915083
23	NC_011888	GCCG	2	8	1945	1952	0 %	0 %	50 %	50 %	220915083
24	NC_011888	CCG	2	6	1965	1970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915083
25	NC_011888	GC	3	6	1973	1978	0 %	0 %	50 %	50 %	220915083
26	NC_011888	CGT	2	6	2013	2018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915083
27	NC_011888	TCG	2	6	2093	2098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915083
28	NC_011888	GCC	2	6	2194	2199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915083
29	NC_011888	CCG	4	12	2232	2243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915083
30	NC_011888	GCCG	2	8	2293	2300	0 %	0 %	50 %	50 %	220915083
31	NC_011888	CCG	2	6	2451	2456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915083
32	NC_011888	AG	3	6	2494	2499	50 %	0 %	50 %	0 %	220915083
33	NC_011888	GC	3	6	2594	2599	0 %	0 %	50 %	50 %	220915083
34	NC_011888	TGCGC	2	10	2628	2637	0 %	20 %	40 %	40 %	220915083
35	NC_011888	ATG	2	6	2666	2671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915083
36	NC_011888	GCC	2	6	2728	2733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915083
37	NC_011888	GGC	3	9	2746	2754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915083
38	NC_011888	TCG	2	6	2786	2791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915083
39	NC_011888	GCG	2	6	2816	2821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915083
40	NC_011888	GGT	2	6	2845	2850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220915083
41	NC_011888	GCC	4	12	2878	2889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915083
42	NC_011888	CGA	2	6	2943	2948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915083
43	NC_011888	GAG	2	6	2983	2988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915083
44	NC_011888	AGG	2	6	3020	3025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915083
45	NC_011888	GCC	2	6	3038	3043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915083
46	NC_011888	TGT	2	6	3104	3109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220915083
47	NC_011888	CGT	2	6	3148	3153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915083
48	NC_011888	GCG	2	6	3170	3175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915083
49	NC_011888	CG	3	6	3220	3225	0 %	0 %	50 %	50 %	220915083
50	NC_011888	CGAGG	2	10	3283	3292	20 %	0 %	60 %	20 %	220915083
51	NC_011888	GCG	2	6	3316	3321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915083
52	NC_011888	GCG	2	6	3341	3346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915083
53	NC_011888	ACG	3	9	3362	3370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915083
54	NC_011888	GCCG	2	8	3378	3385	0 %	0 %	50 %	50 %	220915083
55	NC_011888	CTC	2	6	3427	3432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220915083
56	NC_011888	CCGG	2	8	3552	3559	0 %	0 %	50 %	50 %	220915083
57	NC_011888	CG	3	6	3563	3568	0 %	0 %	50 %	50 %	220915083
58	NC_011888	CGG	2	6	3571	3576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915083
59	NC_011888	TCG	2	6	3584	3589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915083
60	NC_011888	AAG	2	6	3631	3636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220915083
61	NC_011888	CGC	2	6	3676	3681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915083
62	NC_011888	CCG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915083
63	NC_011888	TCG	2	6	3719	3724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915083
64	NC_011888	CATCC	2	10	3738	3747	20 %	20 %	0 %	60 %	220915083
65	NC_011888	CCG	2	6	3762	3767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915083
66	NC_011888	ACG	2	6	3869	3874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915083
67	NC_011888	GCG	2	6	3968	3973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915083
68	NC_011888	CGG	2	6	3975	3980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915083
69	NC_011888	AGC	2	6	3998	4003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915083
70	NC_011888	GCGG	2	8	4047	4054	0 %	0 %	75 %	25 %	220915083
71	NC_011888	GCC	2	6	4205	4210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915083
72	NC_011888	CGG	2	6	4246	4251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915083
73	NC_011888	GCTT	2	8	4289	4296	0 %	50 %	25 %	25 %	220915083
74	NC_011888	CGC	2	6	4314	4319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915083
75	NC_011888	ACTC	2	8	4350	4357	25 %	25 %	0 %	50 %	220915083
76	NC_011888	CCA	2	6	4372	4377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220915084
77	NC_011888	GGC	2	6	4427	4432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915084
78	NC_011888	TGA	2	6	4438	4443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915084
79	NC_011888	CCA	2	6	4449	4454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220915084
80	NC_011888	CCGT	2	8	4568	4575	0 %	25 %	25 %	50 %	220915084
81	NC_011888	CGGCCG	2	12	4612	4623	0 %	0 %	50 %	50 %	220915084
82	NC_011888	GC	3	6	4631	4636	0 %	0 %	50 %	50 %	220915084
83	NC_011888	GCC	3	9	4648	4656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915084
84	NC_011888	TCGA	2	8	4691	4698	25 %	25 %	25 %	25 %	220915085
85	NC_011888	ACA	2	6	4778	4783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915085
86	NC_011888	GAG	2	6	4813	4818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915085
87	NC_011888	CCA	2	6	4909	4914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220915085
88	NC_011888	CGC	2	6	4976	4981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915085
89	NC_011888	CGC	2	6	4992	4997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915085
90	NC_011888	TCCA	2	8	5029	5036	25 %	25 %	0 %	50 %	220915085
91	NC_011888	GCCG	2	8	5055	5062	0 %	0 %	50 %	50 %	220915085
92	NC_011888	GAG	2	6	5065	5070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915085
93	NC_011888	GGC	2	6	5071	5076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915085
94	NC_011888	ACG	2	6	5081	5086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915085
95	NC_011888	CTC	2	6	5149	5154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220915085
96	NC_011888	TGCGC	2	10	5165	5174	0 %	20 %	40 %	40 %	220915085
97	NC_011888	CCG	2	6	5180	5185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915085
98	NC_011888	TGG	3	9	5195	5203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220915085
99	NC_011888	GCT	2	6	5289	5294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915085
100	NC_011888	GCC	2	6	5321	5326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915085
101	NC_011888	GAGG	2	8	5332	5339	25 %	0 %	75 %	0 %	220915085
102	NC_011888	GA	3	6	5372	5377	50 %	0 %	50 %	0 %	220915086
103	NC_011888	GC	3	6	5382	5387	0 %	0 %	50 %	50 %	220915086
104	NC_011888	GAG	2	6	5400	5405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915086
105	NC_011888	GCG	2	6	5412	5417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915086
106	NC_011888	AG	3	6	5493	5498	50 %	0 %	50 %	0 %	220915086
107	NC_011888	GCC	2	6	5512	5517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915086
108	NC_011888	TCA	2	6	5539	5544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915086
109	NC_011888	GTT	2	6	5547	5552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220915086
110	NC_011888	TCG	2	6	5829	5834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915087
111	NC_011888	TGAT	2	8	5851	5858	25 %	50 %	25 %	0 %	220915087
112	NC_011888	TCG	2	6	5874	5879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915087
113	NC_011888	AG	3	6	5904	5909	50 %	0 %	50 %	0 %	220915087
114	NC_011888	TGTTCC	2	12	5914	5925	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	220915087
115	NC_011888	TGC	2	6	5976	5981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915087
116	NC_011888	CCTT	2	8	5998	6005	0 %	50 %	0 %	50 %	220915087
117	NC_011888	TGG	2	6	6103	6108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220915087
118	NC_011888	AAC	2	6	6152	6157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915087
119	NC_011888	GTC	2	6	6168	6173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915087
120	NC_011888	CCA	2	6	6206	6211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220915087
121	NC_011888	TTGAT	2	10	6246	6255	20 %	60 %	20 %	0 %	220915087
122	NC_011888	TCA	2	6	6357	6362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915087
123	NC_011888	T	6	6	6409	6414	0 %	100 %	0 %	0 %	220915087
124	NC_011888	TC	3	6	6431	6436	0 %	50 %	0 %	50 %	220915087
125	NC_011888	TTG	2	6	6474	6479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220915087
126	NC_011888	GTC	2	6	6515	6520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915087
127	NC_011888	TGAT	2	8	6701	6708	25 %	50 %	25 %	0 %	220915087
128	NC_011888	TCT	2	6	6738	6743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220915087
129	NC_011888	GCG	2	6	6813	6818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915087
130	NC_011888	CCA	2	6	6869	6874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220915087
131	NC_011888	TTG	2	6	6933	6938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220915087
132	NC_011888	GCA	2	6	6976	6981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915087
133	NC_011888	CCG	2	6	7036	7041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915088
134	NC_011888	TCG	2	6	7045	7050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915088
135	NC_011888	GCG	2	6	7086	7091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915088
136	NC_011888	GC	3	6	7107	7112	0 %	0 %	50 %	50 %	220915088
137	NC_011888	CGC	2	6	7163	7168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915088
138	NC_011888	TCG	2	6	7246	7251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915088
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140	NC_011888	GCG	2	6	7846	7851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915089
141	NC_011888	TCGA	2	8	7853	7860	25 %	25 %	25 %	25 %	220915089
142	NC_011888	CGG	2	6	7893	7898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915089
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249	NC_011888	TAC	2	6	14144	14149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915096
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257	NC_011888	CGAT	2	8	15041	15048	25 %	25 %	25 %	25 %	220915097
258	NC_011888	CGAGT	2	10	15139	15148	20 %	20 %	40 %	20 %	220915097
259	NC_011888	AGC	2	6	15198	15203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915097
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261	NC_011888	GCC	2	6	15337	15342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915097
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263	NC_011888	ACA	2	6	15548	15553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915098
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.